Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms