Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms