Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms