Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms