Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CD164Q04900 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms