Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARDQ03181 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms