Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLCB3Q01970 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLCB3Q01970 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms