Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEX3Q00994 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEX3Q00994 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEX3Q00994 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEX3Q00994 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BEX3Q00994 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEX3Q00994 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BEX3Q00994 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms