Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM2Q00987 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms