Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms