Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms