Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms