Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERVK_113P63121 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms