Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms