Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms