Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL3P58215 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms