Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BACE1P56817 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BACE1P56817 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms