Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP9P55211 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP9P55211 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP9P55211 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP9P55211 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms