Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELLP55199 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELLP55199 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELLP55199 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms