Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms