Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERFP50548 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERFP50548 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERFP50548 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERFP50548 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERFP50548 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms