Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI2P48788 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms