Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRCC3P46736 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCC3P46736 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms