Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PBX2P40425 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBX2P40425 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBX2P40425 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PBX2P40425 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms