Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FDFT1P37268 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms