Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBRP36941 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBRP36941 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LTBRP36941 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBRP36941 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms