Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms