Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms