Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E2P29084 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms