Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC5P28715 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC5P28715 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC5P28715 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms