Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCAP28676 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCAP28676 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCAP28676 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms