Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXP28300 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXP28300 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXP28300 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXP28300 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXP28300 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXP28300 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms