Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms