Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD33P20138 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD33P20138 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD33P20138 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD33P20138 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms