Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF6P18850 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF6P18850 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF6P18850 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF6P18850 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms