Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREB1P16220 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CREB1P16220 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms