Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA1P15085 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPA1P15085 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA1P15085 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA1P15085 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms