Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDPSP14324 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDPSP14324 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FDPSP14324 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FDPSP14324 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FDPSP14324 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FDPSP14324 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDPSP14324 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDPSP14324 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDPSP14324 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms