Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCSHP14314 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCSHP14314 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCSHP14314 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCSHP14314 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCSHP14314 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms