Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT10P13645 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT10P13645 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT10P13645 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT10P13645 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT10P13645 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT10P13645 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms