Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms