Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH1P12882 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH1P12882 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH1P12882 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH1P12882 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH1P12882 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYH1P12882 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYH1P12882 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYH1P12882 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYH1P12882 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYH1P12882 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms