Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms