Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms