Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms