Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V7

SEC11B, Putative signal peptidase complex catalytic subunit SEC11B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11BP0C7V7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC11BP0C7V7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms