Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCP08575 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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