Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTMAP06454 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTMAP06454 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTMAP06454 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTMAP06454 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTMAP06454 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms