Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED1O96006 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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