Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4K4O95819 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4K4O95819 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms